真空烘箱是利用高溫使微生物細胞內的蛋白質凝固變性而達到滅菌的目的。細胞內的蛋白質變性與其本身含水量有關，在菌體受熱時，環境和細胞內含水金越大，蛋自質凝固就越快，反之含水見越少，凝固就越緩慢。因此，與高壓蒸汽滅菌相比，干操箱滅菌所需溫度更高(160~170℃)，時間更長((1-2h)。溫度不能超過180℃，否則，包裝器皿的紙或棉塞就會燒熱，甚至引起燃燒。
真空烘箱的溫度計的溫度是吸收了熱輻射而產生的溫度。而這種熱輻射被吸收的量，與溫度計材質表面的粗糙程度及材質對紅外線輻射的吸收、折射和透射能力等因數有密切聯系。而這時溫度計的讀數也僅僅只能代表溫度計自身吸收紅外線輻射熱后的溫度，而不能代表其它不同材質不同表面狀態工件所吸收熱輻射后的實際溫度。
用戶在初次使用真空烘箱時，建議先做一個應用試驗，即記錄下所需加熱物體的表面狀態、物體的數量、安放位置、儀表和溫度計的讀數。待烘干結束再檢查烘干的效果，從中決定z佳的物品數量和儀表(或溫度計)的讀數。這樣做，可以收到事半功倍的效果。
真空烘箱整體運輸進行安裝的，由于運輸過程中各部件有移位現象，使用時必須對部件進行調正，以保證烘箱的使用效果。一種高密閉性的箱體，除非出廠便是不合格的產品。萬一漏氣如何處理呢？
1、檢查烘箱門上密封，門上密封是否老化，看顏色和彈性，如果老化，可以聯系廠家更換，視鏡的密封圈也不能被忽略，它有可能也是密封不好，漏氣的起因，還是一樣，該更換的必須更換。
2、將所有的閥門依次檢查是否有漏氣現象，檢查方法是將箱體抽真空，當真空度達到一定程度，可用手在關閉的球閥端口堵住出口，如果手有被吸入的感覺可立即更換球閥，表明這個球閥是漏氣的，這個需要一個一個的試。
